Bacterieel landschap is een concept dat de diversiteit van micro-organismen in een bepaalde ecologische omgeving beschrijft. Dit is een belangrijk aspect van het bestuderen van de levensactiviteit van organismen en hun interactie met de omgeving.
Microflora verwijst naar gemeenschappen van bacteriën van verschillende soorten die in verschillende biologische omgevingen leven. Afhankelijk van hun leefgebied kunnen micro-organismen verschillende aantallen en samenstellingen van soorten hebben. In de bodem kunnen bijvoorbeeld veel soorten schimmels, micro-organismen en nuttige bacteriën aanwezig zijn, terwijl in voedsel alleen bacteriën uit het darmgeslacht mogelijk zijn. Bacteriën die in het menselijk lichaam leven, kunnen gunstig zijn voor het lichaam, zoals sommige soorten E. coli. Ze kunnen ook verschillende ziekten veroorzaken als het menselijke immuunsysteem is aangetast. Het menselijk lichaam heeft zijn eigen micro-organismen, die altijd in een bepaald evenwicht bestaan. Er treedt een onbalans op bij verhoogde activiteit van vreemde micro-organismen. Bovendien beïnvloeden voeding en fysieke activiteit de balans van de microflora: ziekten geassocieerd met obesitas, diabetes, enz. vereisen correctie van de omstandigheden en samenstelling van de microflora. Bacteriologen bestuderen microflora om de resistentie ervan tegen verschillende soorten antibiotica te bepalen, waardoor ze kunnen worden gebruikt voor een effectievere behandeling van ziekten die verband houden met dit type microbe. Een voorbeeld is stafylokokken, de veroorzaker van etterende abcessen of diepe septische manifestaties veroorzaakt door dit soort bacteriën. Stafylokokken zijn aanwezig in de normale menselijke microflora, maar er zijn gevallen waarin ze vanuit een wond het lichaam binnendringen. Om de veroorzaker van stafylokokken te identificeren, is het noodzakelijk om een bloedtest uit te voeren en op een voedingsbodem te kweken. Hierna wordt een antibioticabehandeling voorgeschreven, omdat stafylokokkeninfecties dodelijk kunnen zijn als de therapie niet op de juiste manier wordt voorgeschreven.