Golgiho komplex se skládá z 5-10 plochých disků (desek), ve kterých se rozlišuje hlavní prvek - nádrž a několik diktyozomů nebo shluk nádrží. Tyto diktyozomy jsou odděleny a rovnoměrně distribuovány během mitózy nebo buněčného dělení.
Lysozomy, „žaludek“ buňky, se tvoří z vezikul Golgiho komplexu: obsahují trávicí enzymy, které jim umožňují trávit potravu vstupující do cytoplazmy. Jejich vnitřek neboli mycus je vystlán silnou vrstvou polysacharidů, které těmto enzymům brání rozkládat jejich vlastní buněčný materiál.