Kompleks Golgiego składa się z 5-10 płaskich dysków (płytek), w których wyróżnia się główny element - zbiornik i kilka dyktosomów, czyli skupisko zbiorników. Te dictyosomy są oddzielane i równomiernie rozmieszczone podczas mitozy, czyli podziału komórki.
Lizosomy, „żołądek” komórki, powstają z pęcherzyków kompleksu Golgiego: zawierają enzymy trawienne, które pozwalają im trawić pokarm przedostający się do cytoplazmy. Ich wnętrze, zwane grzybnią, jest wyłożone grubą warstwą polisacharydów, które zapobiegają rozkładowi własnego materiału komórkowego przez te enzymy.