Fórmula estructural:
La cefiaxima es un derivado N-heterocíclico cíclico de la 7-oxotetraciclina. Tiene una estructura peculiar. El anillo de tetraciclina sustituido con heterometanol forma un nuevo grupo en la cadena de carbonos de la molécula de cefalosporina que es casi paralelo a la cadena principal y está unido en la posición 3. Por lo tanto, la cadena principal se estrecha ligeramente en esta ubicación, lo que le da a la cefalina una arquitectura molecular. ligeramente diferente de la morfología de otras cefalosporinas.