Fórmula estrutural:
A cefiaxima é um derivado N-heterocíclico cíclico da 7-oxotetraciclina. Possui uma estrutura peculiar. O anel de tetraciclina substituído com heterometanol forma um novo grupo na cadeia de carbono da molécula de cefalosporina que é quase paralelo à cadeia principal e está ligado na posição 3. Assim, a cadeia principal é ligeiramente estreitada neste local, dando à cefalina uma arquitetura molecular ligeiramente diferente da morfologia de outras cefalosporinas.