Formule structurelle:
Le céfiaxime est un dérivé N-hétérocyclique cyclique de la 7-oxotétracycline. Il a une structure particulière. Le cycle tétracycline substitué par un hétérométhanol forme un nouveau groupe sur la chaîne carbonée de la molécule de céphalosporine qui est presque parallèle à la chaîne principale et est lié en position 3. Ainsi, la chaîne principale est légèrement rétrécie à cet endroit, donnant à la céphaline une architecture moléculaire. légèrement différente de la morphologie des autres céphalosporines.