Szerkezeti képlet:
A cefiaxim a 7-oxotetraciklin ciklikus N-heterociklusos származéka. Különös szerkezete van. A heterometanollal szubsztituált tetraciklin gyűrű egy új csoportot képez a cefalosporin molekula szénláncán, amely majdnem párhuzamos a főlánccal, és a 3-as pozícióban kapcsolódik. Így a főlánc ezen a helyen kissé leszűkült, így a cefalin molekuláris szerkezetet ad. kissé eltér más cefalosporinok morfológiájától.