L'endoderme est un ensemble de couches de cellules situées dans le corps de l'embryon et activement impliquées dans le processus de formation de la peau. Aux premiers stades du développement de l'embryon, il constitue la base cellulaire de l'épithélium à trois couches du futur placenta et du chorion, puis des poumons, des bronches, de la trachée, des bronches principales et d'autres éléments du système respiratoire, du tube digestif, le système génito-urinaire, etc. De là se forme ensuite l'hypoblaste, puis l'endoderme secondaire.