Le autointossicazioni sono cambiamenti patologici che si verificano nel corpo causati da veleni o altre sostanze tossiche formate a seguito di disordini metabolici. In questo caso le tossine non provengono dall'esterno, ma si formano e si accumulano nei tessuti del corpo stesso. Ciò è causato da processi patologici negli organi digestivi e nell'intestino, che non riescono a far fronte alla digestione e all'assorbimento del cibo. Ciò accade a causa di un guasto del metabolismo e delle funzioni dello stomaco e dell'intestino, con conseguente comparsa di autotossine.
Possono essere endogeni, formati all'interno dell'intestino per vari motivi, ed esogeni, che entrano nel corpo dall'esterno insieme a cibo, bevande, aria inalata, ecc. Ad esempio, questa patologia si verifica durante le seguenti disfunzioni nel tratto gastrointestinale e intossicazione del corpo: