Avtointoksikasiyalar maddələr mübadiləsinin pozulması nəticəsində əmələ gələn zəhərlər və ya digər zəhərli maddələrin təsiri ilə orqanizmdə baş verən patoloji dəyişikliklərdir. Bu zaman toksinlər xaricdən gəlmir, orqanizmin öz toxumalarında əmələ gəlir və yığılır. Bu, həzm orqanlarında və bağırsaqlarda qidanın həzminə və udulmasına tab gətirə bilməyən patoloji proseslərdən qaynaqlanır. Bu, maddələr mübadiləsinin və mədə və bağırsaqların funksiyalarının pozulması səbəbindən baş verir, nəticədə avtotoksinlərin meydana gəlməsinə səbəb olur.
Onlar endogen ola bilər, müxtəlif səbəblərdən bağırsağın daxilində əmələ gəlir və ekzogen ola bilər - qida, içki, inhalyasiya edilmiş hava ilə birlikdə bədənə xaricdən daxil olur və s. Məsələn, bu patoloji mədə-bağırsaq traktının aşağıdakı disfunksiyaları və bədənin intoksikasiyası zamanı baş verir: