Az önmérgezések a szervezetben fellépő kóros elváltozások, melyeket mérgek vagy más, az anyagcserezavarok következtében képződött mérgező anyagok okoznak. Ebben az esetben a méreganyagok nem kívülről jönnek, hanem magának a szervezetnek a szöveteiben képződnek és halmozódnak fel. Ezt az emésztőszervekben és a belekben zajló kóros folyamatok okozzák, amelyek nem tudnak megbirkózni az élelmiszer emésztésével és felszívódásával. Ez az anyagcsere, valamint a gyomor és a belek működésének meghibásodása miatt következik be, ami autotoxinok megjelenését eredményezi.
Lehetnek endogének, különböző okok miatt a bélben képződnek, és exogének - kívülről juthatnak be a szervezetbe étellel, itallal, belélegzett levegővel stb. Például ez a patológia a gyomor-bél traktus alábbi diszfunkciói és a szervezet mérgezése során fordul elő: