Autoalergeny to substancje, które wywołują odpowiedź immunologiczną organizmu na własne białko. Zatem proces autoalergiczny rozwija się wewnątrz organizmu i ma swój ograniczony zakres lokalizacji. Najbardziej aktywnym autoantygenem jest infekcja wirusowa, ale istnieją również niezakaźne mechanizmy autoalergiczne.
Autoalergeny wirusowe to specjalna klasa autoantygenów wykrywana w organizmie podczas jednej z infekcji wirusem opryszczki, na przykład wirusem cytomegalii (CMV) lub gorączką Ebola (EBOV). Po infekcji pierwotnej lub infekcji biernej herpeswirus tworzy w komórkach gospodarza ogromne nagromadzenie cząstek wirusa, co prowadzi do aktywacji układu odpornościowego i stymulacji produkcji autoprzeciwciał. Przeciwciała te są specyficzne dla wirusa i mogą znacząco zaszkodzić zdrowiu nosiciela, ponieważ mają tendencję do wiązania immunoglobulin pacjenta.
Autoalergeny rozprzestrzeniają się po całym organizmie i powodują różne reakcje - od objawów miejscowych (zatkanie nosa, kichanie, ból gardła) po ciężkie objawy kliniczne (zespół Weila-Vasilieva, astma oskrzelowa, wtórna małopłytkowość, zespół Guillain-Barre i inne). Ich leczenie zależy od rodzaju i stadium choroby, przyczyny zakażenia oraz cech układu odpornościowego pacjenta. Czasami terapia może obejmować terapię przeciwciałową za pomocą leków zawierających przeciwciała monoklonalne, antybiotyki itp.