Hypofysen (græsk, "under hjernen") er et sæt nerveformationer, der ligger ved bunden af diencephalon, i kraniehulen.
Hypofysen består af to lapper: anterior og posterior. Hos mange dyr er den øvre grænse af den forreste hypofyse på niveau med sella turcica, der adskiller den fra næsehulen, og den bageste grænse er placeret ved bunden af taget af diencephalon. Forlappen er konisk, baglappen er oval. Basen af forlappen ender med en tuberkel, hvis fremspring kaldes sella turcica (substantia nuchae), mens bunden af baglappen umærkeligt går ind i bunden af den tredje ventrikel. Hypofysens forlap frigives fra mellemhjernen og er forbundet med bunden af hypothalamus stilken; De suprasellære (supraturkiske) og intrasellære (vturkiske eller tyrkiske) dele er opdelt af septum (septum medianum sellae cavernosae) i to sektioner. Den første er forbundet med næsehulen og er en del af hypofysetragten og bruges til luft. Og den anden udfylder sella turcica mellem hypotalomet, der støder op til åbningen af sella og den mediale væg af pterygoid-knoglen, mens den smelter sammen med hypothalamus posterior lobe af hypofysen. Over bunden af hypo