En mikroaerofil er en type bakterier, der kræver ilt, men i meget lave koncentrationer. Årsagen til dette er, at mikroaerofile mangler de enzymer, der er nødvendige for at beskytte mod ilttoksicitet.
Mikroaerofile kan vokse ved iltkoncentrationer på 2-10 %, mens iltkoncentrationen i atmosfæren er 21 %. For deres vækst er den optimale iltkoncentration 5-6%.
Mikroaerofile omfatter nogle typer af bakterier, især Campylobacter, Helicobacter pylori, nogle typer streptokokker og meningokokker. De spiller en vigtig rolle i medicin, fordi de kan forårsage forskellige sygdomme.
Mikroaerofile lever ofte på steder med lavt iltindhold - tarmene hos mennesker og dyr, i sår, i mundhulen. For at dyrke dem i laboratoriet skabes særlige forhold med et lavt iltindhold.