Mikroaerofil to rodzaj bakterii, który wymaga tlenu, ale w bardzo niskich stężeniach. Powodem tego jest fakt, że mikroaerofilom brakuje enzymów niezbędnych do ochrony przed toksycznością tlenu.
Mikroaerofile mogą rosnąć przy stężeniu tlenu wynoszącym 2-10%, podczas gdy stężenie tlenu w atmosferze wynosi 21%. Dla ich wzrostu optymalne stężenie tlenu wynosi 5-6%.
Do mikroaerofilów zaliczają się niektóre rodzaje bakterii, w szczególności Campylobacter, Helicobacter pylori, niektóre rodzaje paciorkowców i meningokoków. Odgrywają ważną rolę w medycynie, ponieważ mogą powodować różne choroby.
Mikroaerofile często żyją w miejscach o niskiej zawartości tlenu - jelitach ludzi i zwierząt, w ranach, w jamie ustnej. Aby hodować je w laboratorium, tworzone są specjalne warunki o niskiej zawartości tlenu.