En mikroaerofil er en type bakterier som krever oksygen, men i svært lave konsentrasjoner. Grunnen til dette er at mikroaerofile mangler enzymene som trengs for å beskytte mot oksygentoksisitet.
Mikroaerofile kan vokse ved oksygenkonsentrasjoner på 2-10 %, mens oksygenkonsentrasjonen i atmosfæren er 21 %. For deres vekst er den optimale oksygenkonsentrasjonen 5-6%.
Mikroaerofile inkluderer noen typer bakterier, spesielt Campylobacter, Helicobacter pylori, noen typer streptokokker og meningokokker. De spiller en viktig rolle i medisinen fordi de kan forårsake ulike sykdommer.
Mikroaerofile lever ofte på steder med lavt oksygeninnhold - tarmene til mennesker og dyr, i sår, i munnhulen. For å dyrke dem i laboratoriet skapes spesielle forhold med lavt oksygeninnhold.