**Microbe** est le nom général désignant respectivement les organismes microscopiques (tels que les bactéries et les champignons) et certains organismes multicellulaires (tels que les amibes, les flagellés, les volvox et certains protistes). Le terme est différent du nom de toutes les autres formes de vie mesurant plus de 1 à 5 micromètres : ce n’est pas un microbe. Pour les bactériologistes, le terme micro-organisme a un sens plus large ; il inclut même de nombreux protozoaires.
Les micro-organismes (bactéries ou champignons) sont des créatures vivantes de taille microscopique et dépourvues de plastes ou de mitochondries. Les plus grandes - Mycobacterium marinum et l'ordre des bactéries Rhizobiales - ont généralement une taille de 3 à 7 microns et de nombreux granules de grosses protéines à la surface. Selon leur structure, ils appartiennent aux procaryotes - les organismes cellulaires du superrègne. La plupart se trouvent dans des milieux liquides tels que le sol ou l’eau. Au sein de la taxonomie biologique, les bactéries sont incluses dans le domaine Bactéries (parfois appelées Bactéries), royaume Bac.