**Microbe** is de algemene naam voor respectievelijk microscopische (zoals bacteriën en schimmels) en sommige meercellige organismen (zoals amoeben, flagellaten, volvox en sommige protisten). De term verschilt van de naam van alle andere levensvormen die groter zijn dan 1-5 micrometer: het is geen microbe. Voor bacteriologen heeft de term micro-organisme een bredere betekenis; er vallen zelfs veel protozoa onder.
Micro-organismen (bacteriën of schimmels) zijn levende wezens die microscopisch klein zijn en geen plastiden of mitochondriën hebben. De grootste - Mycobacterium marinum en de orde van bacteriën Rhizobiales - hebben meestal een grootte van 3 tot 7 micron en veel korrels van grote eiwitten op het oppervlak. Volgens hun structuur behoren ze tot prokaryoten - het superkoninkrijk Cellulaire organismen. De meeste worden aangetroffen in vloeibare media zoals grond of water. Binnen de biologische taxonomie worden bacteriën opgenomen in het domein Bacteria (ook wel Bacteria genoemd), koninkrijk Bac.