Ikke-kromosomalt gen er en vitenskap som studerer mekanismene for organismeutvikling uten deltakelse av et kromosomalt sett med DNA. I motsetning til de fleste gener, som finnes på kromosomer, overføres disse genene gjennom kjemiske signaler kontrollert av prosesser utenfor DNA, som for eksempel mitose. Den genetiske koden inneholder ikke direkte instruksjoner for å lage nye proteinmolekyler; i stedet kan signaler for spesifikke aminosyrer komme fra et ikke-kromosom.
Hvordan oppstår ikke-kromosomale genkontrollprosesser? I de fleste organismer er de genetiske kodene inneholdt i et genom, delt mellom deler som kalles alleliske kromatider. Disse kromatidene er som dupliserte kopier av alt DNA, og hver enkelt inneholder en kopi av hvert kromosom og to allelgener. Prosessen med proteinproduksjon begynner når allelgener denatureres og beholdes i kromatinmolekyler som består av proteiner og nukleinsyrer. En sekvens av biokjemiske reaksjoner bestemmer deretter hvilket RNA som er inkorporert i DNAet for å danne en RNA-streng og deretter et protein for å utføre en funksjon i kroppen.
Det er imidlertid andre RNA- og DNA-molekyler, som virus, elementer av kjernefysisk apparat og mitokondrier, som har et genom utenfor det kromosomale rammeverket. Sporadisk oppnådde noen virus evnen til uavhengig å replikere og produsere nye generasjoner i en celle, uavhengig av kromosomer