Blastocoel (Yunanca "embriyo" anlamına gelen "blastos" kelimesinden ve "boşluk" anlamına gelen "koi-loma" kelimesinden gelir), döllenmiş bir yumurtanın ezilmesi sonucu oluşan sıvıyla dolu bir oyuktur. Blastocoel, çok hücreli organizmaların gelişimindeki ilk adımlardan biridir.
Bir sperm yumurtayı döllediğinde, gelecekteki organizmanın orijinal hücresi olan bir zigot oluşur. Zigot bölünmeye başlar, bir dizi ardışık bölünme meydana gelir ve bunun sonucunda morula adı verilen bir hücre kütlesi oluşur. Daha sonra morula bir blastulaya dönüşür ve bir boşluk oluşur - blastocoel.
Blastocoel embriyonun gelişiminde önemlidir. Blastocoel'in içinde, gelecekteki organ ve dokuların temeli olacak hücresel bir katman olan bir blastodisk oluşur. Blastodisk üç katmandan oluşur: endoderm, ektoderm ve mezoderm. Endoderm iç organları, ektoderm deriyi ve sinir sistemini, mezoderm ise kemikleri, kasları ve dolaşım sistemini oluşturur.
Embriyonik gelişim blastoselde başlar ve bu döllenmeden sonraki ilk birkaç gün içinde gerçekleşir. Daha sonra blastocoel, zaten belirgin bir şekle ve katmanlı yapıya sahip olan bir gastrulaya dönüşür.
Sonuç olarak blastoselin çok hücreli organizmaların embriyosunun gelişiminde önemli bir aşama olduğunu söyleyebiliriz. Gelecekteki organizmanın tüm organları ve dokuları blastodiskten oluşur. Bu nedenle blastosölün incelenmesi biyoloji ve tıp alanında önemli bir görevdir.