Vi khuẩn học là một nhánh của vi sinh học nghiên cứu về vi khuẩn.
Vi khuẩn học nói chung nghiên cứu phân loại, cấu trúc và thành phần hóa học của vi khuẩn, khả năng phát triển của vi khuẩn trên các môi trường dinh dưỡng khác nhau và những thay đổi về cơ chất dinh dưỡng cũng như ảnh hưởng của các yếu tố môi trường đến vi khuẩn.
Vi khuẩn y học nghiên cứu các đặc tính của vi khuẩn gây bệnh (gây bệnh) cho con người, phương pháp phân lập, chẩn đoán, các vấn đề về miễn dịch và các vấn đề khác.
Ngoài ra còn có vi khuẩn thú y, nghiên cứu các tác nhân gây bệnh truyền nhiễm ở động vật, vi khuẩn vệ sinh, nông nghiệp và công nghiệp.