Bakteriologie je obor mikrobiologie, který se zabývá studiem bakterií.
Obecná bakteriologie studuje klasifikaci, strukturu a chemické složení bakterií, schopnost bakterií růst na různých živných půdách a z toho vyplývající změny v živných substrátech a také vliv faktorů prostředí na bakterie.
Lékařská bakteriologie studuje vlastnosti patogenních (patogenních) bakterií pro člověka, způsoby jejich izolace, diagnostiky, otázky imunity a další.
Existuje také veterinární bakteriologie, která studuje původce infekčních onemocnění u zvířat, sanitární, zemědělská a průmyslová bakteriologie.