Protein quruluşu: ikincil quruluş
Zülallar orqanizmdə bir sıra əsas funksiyaları yerinə yetirən mürəkkəb və vacib molekullardır. Zülalların müxtəlif xassələri və funksiyaları onların unikal quruluşu ilə müəyyən edilir. Zülal strukturunun əsas cəhətlərindən biri onun polipeptid zəncirinin məkan düzülüşü ilə müəyyən edilən ikinci dərəcəli quruluşudur.
Zülalın ikincil quruluşu kosmosda polipeptid zəncirinin yerli qatlama modelini təsvir edir. Amin turşusu qalıqlarından ibarət olan bitişik peptid qrupları arasında hidrogen bağları hesabına əmələ gəlir. Hidrogen bağları zülalların ikincil strukturunun sabitləşməsində mühüm rol oynayır.
Zülalın ikincil quruluşunun əsas formalarından biri alfa spiral və ya α-sarmaldır. Bu quruluşda polipeptid zənciri spiral forma əmələ gətirir, burada hər bir amin turşusu zəncirdəki qonşu amin turşuları ilə bağlanır. Bir-birinin 4 amin turşusu qalığı daxilində olan amin turşusu qalıqları arasında hidrogen bağları əmələ gəlir. Bu hidrogen bağları spiral quruluşu gücləndirməyə kömək edir.
Zülalın ikincil quruluşunun başqa bir forması beta və ya β-vərəqdir. Bu quruluşda, polipeptid zənciri bitişik amin turşusu qalıqlarının hidrogen bağları ilə bağlandığı "qat" və ya "şəbəkəyə" qatlanır. Polipeptid zənciri paralel və ya antiparalel olduqda beta qatı əmələ gəlir.
Zülalın ikinci dərəcəli quruluşu onun funksiyası üçün vacibdir. Zülalın fiziki və kimyəvi xassələrinə, sabitliyinə, digər molekullarla qarşılıqlı əlaqəsinə və fəaliyyətinə təsir göstərir. Bundan əlavə, ikincili quruluş üçüncü və dördüncü zülal strukturlarının formalaşması üçün əsas ola bilər.
X-şüalarının difraksiyası və nüvə maqnit rezonansı (NMR) kimi üsullar zülalın ikincil strukturunu tədqiq edə və təyin edə bilər. Bu üsullar polipeptid zəncirinin fəza düzülüşü və amin turşusu qalıqlarının qarşılıqlı təsirini görməyə imkan verir.
Yekun olaraq qeyd edək ki, zülalın ikinci dərəcəli strukturu onun xassələrində və funksiyalarında mühüm rol oynayır. Alfa spiral və beta təbəqəsi peptid qrupları arasında hidrogen bağları ilə sabitləşən ikincil quruluşun iki əsas formasıdır. Zülalın ikinci dərəcəli quruluşunu başa düşmək onun funksiyalarını öyrənmək və zülallarla molekulyar əlaqəyə əsaslanan yeni dərman preparatları hazırlamaq üçün böyük əhəmiyyət kəsb edir. Zülalların ikincil strukturu ilə bağlı gələcək tədqiqatlar bioloji proseslər haqqında biliklərimizi genişləndirməyə kömək edəcək və tibb və biotexnologiyada yeni imkanlar açacaqdır.
İkinci dərəcəli protein quruluşu: anlayış və məna
Zülalın ikinci dərəcəli quruluşu onun amin turşularını zəncirlərdə birləşdirərək əmələ gələn fəza quruluşudur. Adı, bunun zülal quruluşu proseslərinin tərkib hissələrindən biri olduğunu və buna görə də bütövlükdə fəaliyyət göstərdiyini göstərir. Mövzu ilə bağlı əsas anlayışlara nəzər salaq.
Amin turşuları
Uzun zəncirlərdə birləşən monomerlərə amin turşuları deyilir. Onlar zülalın ilkin strukturunu təşkil edən əsas elementlərdir. Cəmi 20 əsas amin turşusu var, çünki onların hamısı kimyəvi cəhətdən fərqlidir. Bir hissə (8) aldehidlər, digəri (12) ketonlardır. Onların birləşmələri çoxlu sayda müxtəlif strukturları təşkil edir.
Polipeptidlər artıq mövcud olan amin turşuları zəncirlərindən - onun üçüncü və dördüncü strukturlarının əmələ gəldiyi ikincili zülal birləşmələrindən qurulur.
Kükürd və fosfor atomları peptid bağı əmələ gətirir
Bir amin turşusunun turşu qalıqları və digərinin karbonil qalıqları kimi müxtəlif elementlərin birləşməsinə imkan verən yalnız amin turşuları olmadığını başa düşmək vacibdir. Daha iki atom qrupu bunun öhdəsindən gəlir - fosfor və kükürd.
Fosfor turşusu qrupları sayəsində DNT-də azotlu əsasları saxlamaq mümkündür və serin və treonin oxşar funksiyanı yerinə yetirir.
Bundan əlavə, fosfor bağlarından istifadə edərək protein sarmalları əmələ gəlir. Kükürd peptid bağlarının əmələ gəlməsində də iştirak edir. İki bitişik amin turşusunu bir-birinə yaxın tutmaq üçün C-OH-nin karboksil qrupuna bağlanır. Və eyni kükürd tərkibli zülal sinifləri zülal mədəniyyətləri tərəfindən formalarını qorumaq üçün istifadə olunur.