Yapı Protein İkincil

Protein Yapısı: İkincil Yapı

Proteinler vücutta bir dizi temel işlevi yerine getiren karmaşık ve önemli moleküllerdir. Proteinlerin çeşitli özellikleri ve işlevleri, benzersiz yapıları tarafından belirlenir. Protein yapısının en önemli yönlerinden biri, polipeptit zincirinin uzaysal düzenlemesi tarafından belirlenen ikincil yapısıdır.

Bir proteinin ikincil yapısı, polipeptit zincirinin uzaydaki lokal katlanma modelini tanımlar. Amino asit kalıntılarından oluşan bitişik peptid grupları arasındaki hidrojen bağları nedeniyle oluşur. Hidrojen bağları proteinlerin ikincil yapısının stabilizasyonunda kritik bir rol oynar.

Protein ikincil yapısının ana formlarından biri alfa sarmalı veya a-sarmaldır. Bu yapıda polipeptit zinciri, her bir amino asidin zincirdeki komşu amino asitlerle bağlandığı sarmal bir şekil oluşturur. Birbirinin 4 amino asit kalıntısı içindeki amino asit kalıntıları arasında hidrojen bağları oluşur. Bu hidrojen bağları sarmal yapının güçlendirilmesine yardımcı olur.

Protein ikincil yapısının başka bir biçimi beta sayfası veya β sayfasıdır. Bu yapıda polipeptit zinciri, bitişik amino asit kalıntılarının hidrojen bağlarıyla bağlandığı bir "kat" veya "ağ" halinde katlanır. Beta katı, polipeptit zinciri paralel veya antiparalel olduğunda oluşur.

Bir proteinin ikincil yapısı, işlevi açısından önemlidir. Proteinin fiziksel ve kimyasal özelliklerini, stabilitesini, diğer moleküllerle etkileşimini ve aktivitesini etkiler. Ek olarak ikincil yapı, üçüncül ve dördüncül protein yapılarının oluşumuna temel oluşturabilir.

X-ışını kırınımı ve nükleer manyetik rezonans (NMR) gibi teknikler, bir proteinin ikincil yapısını inceleyebilir ve belirleyebilir. Bu yöntemler, polipeptit zincirinin uzaysal düzenlemesini ve amino asit kalıntılarının etkileşimini görmenize olanak tanır.

Sonuç olarak, bir proteinin ikincil yapısı, onun özelliklerinde ve işlevlerinde önemli rol oynar. Alfa sarmalı ve beta yaprağı, peptit grupları arasındaki hidrojen bağları ile stabilize edilen ikincil yapının iki ana formudur. Bir proteinin ikincil yapısını anlamak, onun işlevlerini incelemek ve proteinlerle moleküler ilişkiye dayalı yeni ilaçlar geliştirmek için büyük önem taşıyor. Proteinlerin ikincil yapısına ilişkin daha fazla araştırma, biyolojik süreçlere ilişkin bilgimizin artmasına yardımcı olacak ve tıp ve biyoteknolojide yeni fırsatlar yaratacaktır.

İkincil protein yapısı: kavram ve anlam

Bir proteinin ikincil yapısı, amino asitlerin zincirlere bağlanmasıyla oluşan uzaysal yapısıdır. Adı, bunun protein yapısındaki süreçlerin bileşenlerinden biri olduğunu ve dolayısıyla bir bütün olarak işleyişini öne sürüyor. Konuyla ilgili temel kavramlara bakalım.

Amino asitler

Amino asitler olarak adlandırılan uzun zincirler halinde bağlanan monomerlerdir. Proteinin birincil yapısını oluşturan anahtar elementlerdir. Toplamda 20 temel amino asit vardır çünkü hepsi kimyasal olarak farklıdır. Bir kısmı (8) aldehitler, diğeri (12) ketonlardır. Kombinasyonları çok sayıda farklı yapı oluşturur.

Polipeptitler, üçüncül ve dördüncül yapılarının oluşturulduğu ikincil protein bileşikleri olan mevcut amino asit zincirlerinden oluşturulur.

Kükürt ve fosfor atomları bir peptid bağı oluşturur

Bir amino asidin asidik kalıntıları ve diğerinin karbonil kalıntıları gibi farklı elementlerin kombinasyonuna izin verenin yalnızca amino asitler olmadığını anlamak önemlidir. Bununla iki atom grubu daha başa çıkıyor - fosfor ve kükürt.

Fosforik asit grupları sayesinde nitrojenli bazların DNA'da tutulması mümkün olup serin ve treonin benzer bir işlevi yerine getirir.

Ayrıca fosfor bağları kullanılarak protein helisleri oluşturulur. Kükürt ayrıca peptid bağlarının oluşumunda da rol alır. İki bitişik amino asidi birbirine yakın tutmak için C-OH'nin karboksil grubuna bağlanır. Ve aynı kükürt içeren protein sınıfları, protein kültürleri tarafından şekillerini korumak için kullanılır.