Axomotorisk synapse, eller intercellulær synapse (fra græsk synapsis - forbindelse og mys, muskos - muskel), eller aksomotorisk synapse, er en struktur, der er placeret mellem axonen (biologisk cylindrisk fiber i muskelvæv), musklens aksiale cylinder og de terminale enheder (motoriske muskelplakker) i de motoriske neuroner, der innerverer det. På grund af sin komplekse struktur er denne type synapse i stand til at omdanne elektriske impulser, der kommer fra centralnervesystemet, til kemiske signaler. Disse mekanismer giver mulighed for koordineret muskelarbejde, hvilket er særligt vigtigt, når man udfører bevægelser.