Παθογένεια είναι ένας όρος που σημαίνει την ικανότητα ενός συγκεκριμένου τύπου μικροοργανισμού, ιού ή παρασίτου να προκαλεί βλάβη στο σώμα. Οι μικροοργανισμοί και άλλα παθογόνα έχουν την ικανότητα να ερεθίζουν, να βλάπτουν ή ακόμα και να καταστρέφουν τις δομές των ζωντανών οργανισμών. Αυτό οδηγεί στην ανάπτυξη ασθένειας ή θανάτου του οργανισμού, συμπεριλαμβανομένων των ανθρώπων. Πάνω από το 50% του παγκόσμιου πληθυσμού έχει μολυνθεί και όλο και περισσότεροι άνθρωποι πέφτουν θύματα πιο σοβαρών μορφών της νόσου. Ένα σημαντικό μέρος όλης της ιατρικής δραστηριότητας, ιδιαίτερα στις αναπτυσσόμενες χώρες, σχετίζεται με τη θεραπεία ασθενειών που προκαλούνται από παθογόνους παράγοντες.
Υπάρχει ένας αριθμός μεθόδων για τον προσδιορισμό του βαθμού παθογένειας των μικροοργανισμών. Κατά την αξιολόγηση της ανοσογονικότητας, λαμβάνεται υπόψη όχι μόνο ο τύπος του παθογόνου, αλλά και οι ιδιότητές του. Τα κύρια χαρακτηριστικά που αντικατοπτρίζουν την ικανότητα ενός παθογόνου να προκαλεί μια συγκεκριμένη παθολογική κατάσταση σε έναν υγιή ξενιστή είναι:
* μολυσματικότητα (ικανότητα πρόκλησης μόλυνσης) * τοξικότητα (προκαλούν αλλαγές στα ζωτικά συστήματα). * αντιδραστικότητα (προκαλούν την εκδήλωση κλινικών συμπτωμάτων).