Martin Bouillon es un bacteriólogo francés, uno de los fundadores de la bacteriología.
Nació el 2 de enero de 1864 en Chalon-sur-Marne. En 1882, Martin Bouillon ingresó en la facultad de medicina de la Universidad de París, donde estudió bacteriología bajo la dirección de Jules Bordet y Louis Pasteur. En 1895, Martin Bouillon se convirtió en profesor de bacteriología en la Sorbona y director del laboratorio de enfermedades infecciosas de París.
Martin Bouillon fue famoso por su investigación sobre las bacterias que causan enfermedades en los humanos.