Martin Bouillon là nhà vi khuẩn học người Pháp, một trong những người sáng lập vi khuẩn học.
Ông sinh ngày 2 tháng 1 năm 1864 tại Chalon-sur-Marne. Năm 1882, Martin Bouillon vào khoa y của Đại học Paris, nơi ông nghiên cứu vi khuẩn học dưới sự hướng dẫn của Jules Bordet và Louis Pasteur. Năm 1895, Martin Bouillon trở thành giáo sư vi khuẩn học tại Sorbonne và giám đốc phòng thí nghiệm các bệnh truyền nhiễm ở Paris.
Martin Bouillon nổi tiếng với nghiên cứu về vi khuẩn gây bệnh ở người.