Les anticorps contre les virus sont appelés immunoglobulines - IgM, IgG, IgA. Les IgM ont un titre maximum dans les premiers jours de la maladie (le sérum du patient commence à le montrer à la fin de la première semaine de la maladie), apparaissent plus tard que les IgM et restent plus longtemps dans le sérum sanguin - jusqu'à plusieurs mois.
Les IgG apparaissent 2 à 3 semaines après le début de la maladie et atteignent leur concentration maximale au cours du deuxième mois de la maladie. À partir de ce moment, la concentration d’IgM diminue progressivement et celle d’IgG augmente. Au début de la deuxième semaine, il peut y avoir une augmentation temporaire des IgM au niveau des IgA (leurs indicateurs sont déjà plus proches de la norme). Si l'analyse par immunoblot montre la présence d'IgM, nous pouvons alors affirmer avec une grande confiance qu'il existe une forme aiguë d'encéphalite virale à tiques (on l'appelle printemps-été ou « sud-russe »).
Si le sérum ne montre pas d'immunoglobules lors de l'analyse ELISA, cela ne signifie pas que la personne ne possède pas d'anticorps. Le principal problème réside dans la faiblesse des systèmes de test. Le fait est que, après avoir été infectées par une encéphalite à tiques, les cellules du système immunitaire commencent « à la hâte » à produire