Антителата срещу вирусите се наричат имуноглобулини - IgM, IgG, IgA. IgM имат максимален титър в първите дни на заболяването (серумът на пациента започва да го показва в края на първата седмица от заболяването), появяват се по-късно от IgM и остават по-дълго в кръвния серум - до няколко месеца.
IgG се появява 2-3 седмици след началото на заболяването и достига максимална концентрация през втория месец на заболяването. От този момент нататък концентрацията на IgM постепенно намалява, а IgG се увеличава. В началото на втората седмица може да има временно повишаване на IgM на ниво IgA (техните показатели вече са по-близо до нормата). Ако имуноблот анализът покаже наличието на IgM, тогава можем да кажем с голяма увереност, че има остра форма на вирусен енцефалит, пренасян от кърлежи (нарича се пролетно-лято или „южен руски“).
Ако серумът не показва имуноглобули по време на ELISA анализ, това не означава, че лицето няма антитела. Основният проблем са слабите тестови системи. Факт е, че след като са се заразили с енцефалит, пренасян от кърлежи, клетките на имунната система „бързо“ започват да произвеждат