A vírusok elleni antitesteket immunglobulinoknak nevezik - IgM, IgG, IgA. Az IgM maximális titere a betegség első napjaiban van (a beteg széruma a betegség első hetének végén kezd megjelenni), később jelenik meg, mint az IgM, és tovább marad a vérszérumban - akár több hónapig.
Az IgG a betegség kezdete után 2-3 héttel jelenik meg, és a betegség második hónapjában éri el maximális koncentrációját. Ettől kezdve az IgM koncentrációja fokozatosan csökken, és az IgG növekszik. A második hét elején átmenetileg emelkedhet az IgM az IgA szintjén (mutatóik már közelebb állnak a normához). Ha az immunblot analízis kimutatja az IgM jelenlétét, akkor nagy biztonsággal kijelenthetjük, hogy létezik a kullancs által terjesztett vírusos agyvelőgyulladás akut formája (tavaszi-nyárinak vagy „dél-orosznak” nevezik).
Ha az ELISA analízis során a szérum nem mutat immunglobulusokat, ez nem jelenti azt, hogy a személynek nincsenek ellenanyagai. A fő probléma a gyenge tesztrendszerek. A helyzet az, hogy a kullancsencephalitis megfertőződése után az immunrendszer sejtjei „sietve” termelni kezdenek.