Kerongkongan terkadang mengalami berbagai kelainan alami yang melemahkan kemampuannya dalam melakukan fungsinya, yaitu menelan. Segala macam penyakit instrumen dan penyakit terkait terjadi di dalamnya, di mana tumor panas, dingin dan keras terbentuk, di antara penyakit instrumen, penyumbatan paling sering terjadi di dalamnya; hal ini terjadi karena tekanan eksternal yang berasal dari tulang belakang yang bergeser atau dari tumor di organ tetangga, atau karena pembengkakan pada esofagus itu sendiri atau otot yang menahannya agar tetap tegak. Penyakit penyerta yang terjadi pada kerongkongan antara lain pendarahan dan pendarahan akibat pecahnya pembuluh darah.
Ketahuilah bahwa menelan dilakukan oleh kerongkongan dengan bantuan gaya retraksi, yang menarik makanan melalui aksi serat memanjang; dibantu oleh serabut melintang, menahan makanan yang tertelan di belakang dan menekannya ke bawah. Muntah juga dilakukan melalui aksi kerongkongan, tetapi menelan lebih mudah, karena gerakan ini terjadi secara alami dengan bantuan dua membran, yang satu memiliki serat memanjang, dan yang lainnya, yang membungkusnya, dilengkapi dengan serat melintang. Adapun muntah merupakan gerakan yang tidak terjadi secara alami, suatu tindakan yang dilakukan hanya dengan bantuan satu selaput pemeras yang membungkus.