Tratamento especial é um conjunto de medidas químicas e físico-químicas destinadas a remover micróbios de materiais tecnológicos e instalações de produção, bem como de equipamentos e ferramentas que estiveram em contato com os materiais processados. Assim, antes de mais nada, é necessário considerar a estrutura qualitativa e quantitativa da microflora das soluções tecnológicas contendo substâncias biologicamente ativas, que depende da finalidade de sua utilização. O processo de processamento especial inclui as seguintes etapas:
1. O pré-tratamento consiste na lavagem completa dos equipamentos (tanques de processo, tubulações, etc.) com soluções de detergentes de espuma, água quente e agentes alcalinos. 2. A fase preparatória consiste no seguinte: antes da descontaminação, são dosados e instalados recipientes especiais no interior das instalações de produção, que conterão produtos a serem tratados com uma composição especial. 3. A etapa de tratamento especial direto envolve o uso repetido de soluções desinfetantes, que representam cerca de 85% do volume restante após a preparação do ambiente. O resto são resíduos de produção neutralizados. 4. O controlo é obrigatório em cada fase do processo de processamento e consiste na monitorização selectiva da actividade dos reagentes químicos. A eficácia e qualidade do efeito desinfetante da mistura são determinadas pelo indicador microbiológico, ou seja, pela identificação da presença ou ausência de microrganismos na mesma. Caso seja detectada contaminação bacteriana da água, o tratamento é continuado, enquanto suas proporções são ajustadas (a dose é aumentada em quantidade igual ao volume de novas porções de resíduos). Este processo é repetido até que a amostra final atenda aos requisitos da SanPiN 2.1.4.559-96 “Água potável. Requisitos higiénicos para a qualidade da água dos sistemas centralizados de abastecimento de água potável. Controle de qualidade". 5. A fase final (desinfecção de objetos) inclui ventilação das instalações, substituição de desinfetantes, lavagem e secagem de equipamentos tecnológicos, inventário e mobiliário das instalações.