Trypsiini on voimakas entsyymi ruoansulatusjärjestelmässä, joka hajottaa proteiineja.
Trypsiini syntetisoituu haimassa ja on osa mahanestettä ja haimamehua. Trypsiini on proteolyyttinen entsyymi. Entsyymi sisältää kolme peptidisidosta ja on välttämätön sellaisten proteiinien hajottamiseksi, joita pepsiini, amylaasi ja lipaasi eivät pysty hajottamaan. Trippiniä käytetään tulehduksellisten ja infektiosairauksien hoitoon, joihin liittyy lankojen muodostumista ja hankausta. Sitä käytetään myös kosmetologiassa ikäpisteiden poistamiseen. Se on vasta-aiheinen maksasairauksissa ja maha-suolikanavan vaurioissa. Saattaa aiheuttaa allergisia reaktioita ja verenvuotoa. Sitä ei suositella käytettäväksi raskauden ja imetyksen aikana. Se on myös vasta-aiheinen lapsille.