A proto-kooperáció (a görög "protos" - először és a latin "cooperatio" - együttműködés) egy olyan interakció módja két populáció között, amelyben mindegyik részesül a másik jelenlétéből, de létezhet anélkül. Ilyen kapcsolatok lehetnek a természetben előforduló fajok vagy az üzleti életben működő vállalatok között.
A természetben protokooperáció lép fel például a virágok és beporzóik között. A virág biztosítja a beporzó számára a más virágok megtermékenyítéséhez szükséges pollent, a beporzó pedig átadja a pollent más virágoknak, segítve a megtermékenyítést. A folyamat mindkét résztvevője előnyös: a virág lehetőséget kap a szaporodásra, a beporzó pedig nektár formájában jut táplálékhoz, amelyet a virág választ ki.
Az üzleti életben proto-együttműködés létrejöhet két olyan vállalat között, amelyek nem versenytársak, de kölcsönhatásba lépnek egymással, hogy előnyöket szerezzenek. Például egy bútorgyártó partnerséget köthet egy kárpitszövet-gyártóval, hogy kedvezőbb áron szerezze be az alapanyagokat, és a szövetgyártó megrendeléseket kap termékeire.
A protocooperáció egy fontos interakciós mechanizmus, amely lehetővé teszi a résztvevők számára, hogy hasznot húzzanak az együttműködésből. Az ilyen kapcsolatok hosszú ideig tarthatnak, és kölcsönösen előnyösek lehetnek minden résztvevő számára. Ha azonban az egyik résztvevő megszűnik hasznot húzni, akkor a proto-együttműködés megszakadhat. Ezért fontos annak biztosítása, hogy a proto-együttműködés minden résztvevője részesüljön ezekből a kapcsolatokból, és ezeket a kapcsolatokat hosszú ideig fenntartsa.