Saat ini, definisi "Escherichia coli" atau "E. Coli" adalah nama umum untuk keluarga bakteri yang hidup di usus dan melakukan sejumlah fungsi penting dalam sistem pencernaan kita. Bakteri ini juga dikenal sebagai patogen paling umum dan dapat menyebabkan berbagai macam penyakit, termasuk keracunan makanan, diare, infeksi usus, radang usus buntu dan lain-lain.
Namun tidak semua E. coli sama, dan karakteristiknya mungkin berbeda-beda. Baru-baru ini, Indeks Escherichia coli (ECI) dikembangkan, yang mengukur jumlah spesies E. coli yang ditemukan dalam sampel tinja. Skor ini disebut indeks E. coli atau indeks coli dan dapat digunakan untuk menilai kesehatan usus dan risiko berkembangnya penyakit terkait enterik.
Dalam analisis gambar tinja, flora usus paling sering diperiksa berdasarkan definisi Indeks Flora Usus (COI), yaitu jumlah unit pembentuk koloni (CFU) bakteri per gram tinja. Lebih spesifiknya, indeks coli didefinisikan sebagai jumlah CFU bakteri E. coli lebih dari dua ribu per gram sampel. Namun, parameter ini tidak boleh diartikan secara harfiah - misalnya, jika sampel dari usus mengandung beberapa ribu bakteri, ini tidak berarti ada risiko terkena penyakit, dan angka seribu bakteri juga tidak bersifat diagnostik.
Mengapa flora usus dinilai? Kehadiran mikroflora usus normal yang cukup menyiratkan keseimbangan fungsi usus, karena ia bertanggung jawab untuk pencernaan makanan yang normal dan menghilangkan zat beracun dari tubuh. Tetapi komposisi fauna usus yang tidak seimbang (sedikit perwakilan yang "baik", kelebihan "sinyal" yang "buruk") tentang kemungkinan perkembangan penyakit, misalnya, seperti maag kronis atau radang usus besar