Foreløpig er definisjonen av "Escherichia coli" eller "E. Coli" er det vanlige navnet på en familie av bakterier som lever i tarmene og utfører en rekke viktige funksjoner i fordøyelsessystemet vårt. Disse bakteriene er også kjent som de vanligste patogenene og kan forårsake et bredt spekter av sykdommer, inkludert matforgiftning, diaré, tarminfeksjoner, blindtarmbetennelse og andre.
Men ikke alle E. coli er like, og deres egenskaper kan variere. Nylig ble Escherichia coli Index (ECI) utviklet, som måler antall E. coli-arter funnet i en avføringsprøve. Denne poengsummen kalles E. coli-indeksen eller coli-indeksen og kan brukes til å vurdere tarmhelsen og risikoen for å utvikle tarmrelaterte sykdommer.
I avføringsbildeanalyse undersøkes tarmfloraen oftest etter definisjonen av Gut Flora Index (COI), som er antall kolonidannende enheter (CFU) av bakterier per gram avføring. Mer spesifikt er coli-indeksen definert som antall CFU av E. coli-bakterier over to tusen per gram prøve. Denne parameteren skal imidlertid ikke tas bokstavelig – for eksempel hvis prøver fra tarmen inneholder flere tusen bakterier, betyr ikke dette at det er fare for å utvikle sykdommen, og et tall på tusen bakterier er heller ikke diagnostisk.
Hvorfor vurderes tarmfloraen? Tilstedeværelsen av tilstrekkelig normal tarmmikroflora innebærer en balansert tarmfunksjon, siden den er ansvarlig for normal fordøyelse av mat og fjerner giftige stoffer fra kroppen. Men den ubalanserte sammensetningen av tarmfaunaen (få "gode" representanter, et overskudd av "dårlige") "signaler" om mulig utvikling av sykdommer, for eksempel som kronisk gastritt eller kolitt