В момента дефиницията на "Escherichia coli" или "E. Coli" е общоприетото име за семейство бактерии, които живеят в червата и изпълняват редица важни функции в нашата храносмилателна система. Тези бактерии са известни и като най-често срещаните патогени и могат да причинят широк спектър от заболявания, включително хранително отравяне, диария, чревни инфекции, апендицит и други.
Но не всички E. coli са еднакви и техните характеристики може да варират. Наскоро беше разработен индексът на Escherichia coli (ECI), който измерва броя на видовете E. coli, открити в проба от изпражнения. Този резултат се нарича индекс на E. coli или индекс на коли и може да се използва за оценка на здравето на червата и риска от развитие на чревни заболявания.
При анализа на изображението на изпражненията, чревната флора най-често се изследва според дефиницията на индекса на чревната флора (COI), който е броят на единиците, образуващи колонии (CFU) от бактерии на грам изпражнения. По-конкретно, коли индексът се определя като брой CFU на E. coli бактерии над две хиляди на грам проба. Този параметър обаче не трябва да се приема буквално - например, ако проби от червата съдържат няколко хиляди бактерии, това не означава, че има риск от развитие на заболяването, а цифра от хиляда бактерии също не е диагностична.
Защо се оценява чревната флора? Наличието на достатъчна нормална чревна микрофлора предполага балансирана чревна функция, тъй като тя е отговорна за нормалното смилане на храната и премахва токсичните вещества от тялото. Но небалансираният състав на чревната фауна (малко „добри“ представители, излишък от „лоши“) „сигнализира“ за възможното развитие на заболявания, например като хроничен гастрит или колит