Hiện tại, định nghĩa về "Escherichia coli" hoặc "E. Coli" là tên gọi chung của một họ vi khuẩn sống trong ruột và thực hiện một số chức năng quan trọng trong hệ tiêu hóa của chúng ta. Những vi khuẩn này còn được gọi là mầm bệnh phổ biến nhất và có thể gây ra nhiều loại bệnh, bao gồm ngộ độc thực phẩm, tiêu chảy, nhiễm trùng đường ruột, viêm ruột thừa và các bệnh khác.
Nhưng không phải tất cả E. coli đều giống nhau và đặc điểm của chúng có thể khác nhau. Gần đây, Chỉ số Escherichia coli (ECI) đã được phát triển để đo số lượng loài E. coli được tìm thấy trong mẫu phân. Điểm này được gọi là chỉ số E. coli hoặc chỉ số coli và có thể được sử dụng để đánh giá sức khỏe đường ruột cũng như nguy cơ phát triển các bệnh liên quan đến đường ruột.
Trong phân tích hình ảnh phân, hệ thực vật đường ruột thường được kiểm tra theo định nghĩa của Chỉ số thực vật đường ruột (COI), là số lượng đơn vị hình thành khuẩn lạc (CFU) của vi khuẩn trên mỗi gam phân. Cụ thể hơn, chỉ số coli được định nghĩa là số lượng CFU của vi khuẩn E. coli trên hai nghìn trên mỗi gam mẫu. Tuy nhiên, thông số này không nên được hiểu theo nghĩa đen - ví dụ: nếu mẫu từ ruột chứa vài nghìn vi khuẩn, điều này không có nghĩa là có nguy cơ phát triển bệnh và con số một nghìn vi khuẩn cũng không mang tính chẩn đoán.
Tại sao hệ thực vật đường ruột được đánh giá? Sự hiện diện của hệ vi sinh đường ruột bình thường đầy đủ hàm ý chức năng đường ruột cân bằng, vì nó chịu trách nhiệm tiêu hóa thức ăn bình thường và loại bỏ các chất độc hại ra khỏi cơ thể. Nhưng thành phần không cân bằng của hệ vi sinh vật đường ruột (ít đại diện “tốt”, thừa đại diện “xấu”) “tín hiệu” về khả năng phát triển của các bệnh, chẳng hạn như viêm dạ dày mãn tính hoặc viêm đại tràng.