Фаринготомия предполагает рассечение одной или нескольких складок слизистой оболочки ротоглотки, располагающихся преимущественно в переднем ее отделе (надгортанниковой части), с последующим их восстановлением, однако в ряде случаев ход манипуляции зависит от конкретных клинических показаний. В ходе фаринготомии часто удаляется содержимое кист и гранулем гортани и голосового аппарата.