La teoría de la selección clonal, también conocida como teoría de Burnet, es una teoría de la inmunidad propuesta por el inmunólogo australiano Frank Macfarlane Burnet en 1959.
Según esta teoría, el sistema inmunológico está formado por muchos linfocitos, cada uno de los cuales lleva en su superficie un receptor de reconocimiento de antígenos único. Estos receptores se generan aleatoriamente mediante mutaciones somáticas en los genes que codifican los componentes del receptor.
Cuando un linfocito choca con un antígeno extraño, se produce proliferación y diferenciación clonal de aquellas pocas células cuyos receptores se unen específicamente a este antígeno. Este proceso se llama selección clonal. Así, el sistema inmunológico selecciona los pocos linfocitos que pueden reconocer un antígeno particular y los multiplica para combatir la infección.
La teoría de la selección clonal explicó el mecanismo de especificidad de la respuesta inmunitaria y avanzó significativamente en la comprensión del funcionamiento del sistema inmunitario. Sigue siendo un concepto fundamental en inmunología.