Teoria selekcji klonalnej, znana również jako teoria Burneta, jest teorią odporności zaproponowaną przez australijskiego immunologa Franka Macfarlane’a Burneta w 1959 roku.
Według tej teorii układ odpornościowy składa się z wielu limfocytów, z których każdy niesie na swojej powierzchni unikalny receptor rozpoznający antygen. Receptory te powstają losowo w wyniku mutacji somatycznych w genach kodujących składniki receptora.
Kiedy limfocyt zderza się z obcym antygenem, następuje proliferacja klonalna i różnicowanie tych kilku komórek, których receptory specyficznie wiążą się z tym antygenem. Proces ten nazywany jest selekcją klonalną. W ten sposób układ odpornościowy wybiera kilka limfocytów, które potrafią rozpoznać konkretny antygen i namnaża je, aby zwalczyć infekcję.
Teoria selekcji klonalnej wyjaśniła mechanizm swoistości odpowiedzi immunologicznej i znacząco pogłębiła wiedzę na temat funkcjonowania układu odpornościowego. Pozostaje podstawową koncepcją w immunologii.