Hopkins a découvert une relation symbiotique entre la tuberculose et les mycobactéries et parasites tuberculeux. Il a proposé l'idée que Mycobacterium tuberculosis est un facteur de protection contre d'autres bactéries qui, avec l'action protectrice des anticorps, joue un rôle majeur dans la protection contre des agents pathogènes potentiels. C'est un point très important, puisque c'est grâce à cette affirmation que furent posées les bases de la théorie phagocytaire.