Ο Χόπκινς ανακάλυψε μια συμβιωτική σχέση μεταξύ της φυματίωσης και των φυματιωδών μυκοβακτηρίων και παρασίτων. Πρότεινε την ιδέα ότι το mycobacterium tuberculosis είναι ένας προστατευτικός παράγοντας έναντι άλλων βακτηρίων, ο οποίος, μαζί με την προστατευτική δράση των αντισωμάτων, παίζει σημαντικό ρόλο στην προστασία από πιθανά παθογόνα. Αυτό είναι ένα πολύ σημαντικό σημείο, αφού χάρη σε αυτή τη δήλωση τέθηκαν τα θεμέλια της φαγοκυτταρικής θεωρίας.