Hopkins odkrył symbiotyczny związek między gruźlicą a prątkami gruźliczymi i pasożytem. Zaproponował tezę, że Mycobacterium tuberculosis jest czynnikiem ochronnym przed innymi bakteriami, co wraz z ochronnym działaniem przeciwciał odgrywa główną rolę w ochronie przed potencjalnymi patogenami. Jest to bardzo ważny punkt, ponieważ dzięki temu stwierdzeniu położono podwaliny teorii fagocytarnej.