Hopkins scoprì una relazione simbiotica tra la tubercolosi, i micobatteri tubercolari e i parassiti. Ha proposto l'idea che il mycobacterium tuberculosis sia un fattore protettivo contro altri batteri che, insieme all'azione protettiva degli anticorpi, svolge un ruolo importante nella protezione contro potenziali agenti patogeni. Questo è un punto molto importante, poiché è grazie a questa affermazione che furono gettate le basi della teoria dei fagociti.