Hopkins objevil symbiotický vztah mezi tuberkulózou a tuberkulózními mykobakteriemi a parazity. Navrhl myšlenku, že mycobacterium tuberculosis je ochranný faktor proti jiným bakteriím, který spolu s ochranným působením protilátek hraje hlavní roli v ochraně před potenciálními patogeny. To je velmi důležitý bod, protože právě díky tomuto prohlášení byly položeny základy fagocytární teorie.