Histogenese is een natuurlijk proces van het ontstaan, de ontwikkeling en de organisatie van structurele elementen van historisch voorgaande levensvormen tot nieuwe, kwalitatief complexere vormen, in dit geval een organisme. Histogenese houdt rekening met zowel premorfologische veranderingen die optreden in gespecialiseerde cellen en structuren, als met verschijnselen die optreden in verband met de vorming van morfologische velden.