Autonome reflexen (autonome, trofische, tropinoïnen), evenals somatische, zijn afhankelijk van externe factoren (voornamelijk stimuli, zowel exogeen als intern) en van de toestand van het lichaam, maar werken in grotere mate in op organen en weefsels zonder de deelname ervan. van bewustzijn. Een voorbeeld van zo'n reflex is braken tijdens vergiftiging. In tegenstelling tot somatische reflexen kunnen vegetatieve reflexen worden geclassificeerd: ongeconditioneerd, attitudinaal en geconditioneerd. Irritatie eindigt meestal met het verdwijnen ervan (het zogenaamde verlies van reflex). Een voorbeeld van dergelijke reflexen is maagsecretie veroorzaakt door voedsel. Als we bijvoorbeeld snoep willen eten, kijken we ernaar, we willen het. In feite is dit een autonome reactie en deze vindt plaats in enkele milliseconden, d.w.z. als we snoep eten, zijn de zenuwuiteinden in de tong geïrriteerd en is er een reactie van de afscheiding van de maag, en vervolgens van de lever en de alvleesklier: de productie van gal. Hier is een complex schema voor de synthese van gal en spijsvertering