Vagotomieën zijn chirurgische ingrepen waarbij de autonome zenuw die interne organen voedt, wordt doorgesneden of verdeeld en weggesneden. In ons land worden deze operaties voornamelijk uitgevoerd voor maagzweren, chronische pancreatitis of darmkanker. Meestal wordt vagotomie uitgevoerd met een vagotomie (proximaal, mediaal of lateraal).
Vagotomieën helpen de secretie te verminderen, de bloedvaten te verwijden, de maaglediging te versnellen en de uitstroom van gal te verbeteren. Na een dergelijke operatie blijven de functie, beweeglijkheid en innervatie van de maag behouden. Dit leidt niet tot vasten en de persoon kan elk voedsel eten.